大规模的癌症突变遗传图谱已编入目录–可供全球的医生和研究人员使用

从恶性胶质母细胞瘤制备的染色体，通过光谱核型分析（SKY）可视化，显示出极大程度的染色体不稳定-这是癌症的标志。

来自哥本哈根大学，奥尔胡斯大学，奥尔胡斯大学医院和Rigshospitalet等人的国际研究人员团队通过全基因组分析，对38种不同类型的癌症中的突变进行了定位。研究人员已经编制了一份有关癌症突变的目录，该目录将在全球范围内提供给医生和研究人员。

在全球范围内，癌症是最大的杀手之一，2018年，估计有960万人死于该疾病。为了提供对该疾病的最佳治疗，必须找出导致癌症的突变。

“我们已经研究和分析了整个基因组，并且我们对影响癌症基因的突变进行了分析，从而使我们能够通过遗传方法从遗传学角度解释我们研究的95％的癌症发生。”—约阿希姆·魏申费尔特（Joachim Weischenfeldt）

在一项名为全基因组全癌基因分析（PCAWG）的大型国际合作中，来自哥本哈根大学，奥尔胡斯大学，奥尔胡斯大学医院和Rigshospitalet的研究人员帮助绘制了38种不同类型癌症的突变图。

所有的突变都被合并到一个目录中。该目录已经可以在线获取，它使来自世界各地的医生和研究人员可以查找相关信息，咨询并查找有关特定患者癌症的信息。

‘以前的大多数重大研究都集中在编码占基因组2％的蛋白质上。我们已经研究和分析了整个基因组，并且通过对影响癌症基因的突变进行分析，使我们能够通过遗传学方式解释我们研究的95％的癌症发生率。''哥本哈根大学生物技术研究与创新中心和Rigshospitalet Finsen实验室。

‘因此，如果您知道哪些突变导致了癌症，即所谓的驱动程序突变，您将能够更好地定制使用最合适药物的治疗方法或设计抗癌新药。精准医学完全取决于每种癌症中驱动因子突变的定位以及诊断，预后和改善的治疗方法，''合著者，奥尔胡斯大学和奥尔胡斯生物信息学研究中心教授以及临床医学系教授Jakob Skou Pedersen说。大学医院。

新的研究结果发表在科学期刊《自然》（Nature）的特别版上，重点是PCAWG。迄今为止，它是最大的原发癌全基因组研究。这意味着分析是基于肿瘤起源的组织中的材料并且在患者接受任何治疗之前进行的。

从少数突变到100,000种突变

研究人员主要分析并获得了最常见癌症类型的数据，例如肝癌，乳腺癌，胰腺癌和前列腺癌。总共，他们分析了来自2,600多名患者的全基因组测序肿瘤样本。

根据他们的分析，他们可以看到癌症类型中的突变数量相差很大。儿童的髓样异常增生和癌症几乎没有突变，而肺癌中可能有多达100,000个突变。

该信息图是在Pan-Cancer Project中研究的不同癌症类型的概述。下半部分还列出了可获取最多样本的六种癌症类型（男性和女性）。

但是，即使突变的数量范围很广，研究人员仍可以看到，平均而言，总有4-5个突变正在驱动该疾病，即所谓的驱动因子-无论它是哪种癌症。

‘令人惊讶的是，几乎所有的人都有相同数量的驱动程序突变。但是，与理论相一致的是，癌性肿瘤需要在事情开始出现问题之前改变细胞中的某些机制，’雅各布·斯科·佩德森（Jakob Skou Pedersen）说。

在目录中，研究人员将这些突变分为驾驶员和乘客。驱动程序突变为癌症提供了增长益处，而乘客突变涵盖了所有其他突变并且无害。所有变异中的绝大多数是乘客。

遗传学或组织

为了存储和处理大量数据，研究团队使用了所谓的云计算，使用了分布在三大洲的13个数据中心。他们在欧洲，美国和亚洲设有中心。

建立大型数据集对于确定不同类型癌症的共同点和独特点是必不可少的。如今，癌症是根据疾病起源的组织（例如乳房，大脑和前列腺）而消沉的。

研究人员发现了许多对于每种类型的组织都是完全独特的事物。相反，他们还发现了跨组织类型的许多共同特征。根据Joachim Weischenfeldt的说法，因此有必要重新考虑我们对癌症的看法。

‘癌症是一种遗传疾病，突变的类型通常比癌症起源于身体的位置更为重要。这意味着我们不仅需要将癌症视为组织特有的疾病，还要根据遗传学和其突变来进行研究。’

‘例如，我们可能患有某种类型的乳腺癌和前列腺癌，其驱动程序突变相似。这就是说，前列腺癌患者可能会从与乳腺癌患者相同的治疗中受益，因为这两种类型都有重要的驱动突变，’Joachim Weischenfeldt说。

参考：ICGC / TCGA全基因组财团的全癌分析，“全基因组的全癌分析”，2020年2月5日，Nature.DOI：
10.1038 / s41586-020-1969-6

国际癌症基因组研究联盟得到了包括丹麦独立研究基金会在内的国家基金会的支持。