从土壤中提取长期植物和动物的古代DNA

Tyler Murchie是人类学部的博士候选人和该研究的主要作者。

用新的DNA恢复技术揭示了过去的更丰富的图片。

McMaster大学的研究人员已经开发出一种从土壤中梳理古代DNA的新技术，拉动数百只动物的基因组和数千种植物 - 其中许多长期灭绝 - 从少于一克沉积物。

议程研究中概述的DNA提取方法允许科学家重建一千年前存在的环境中最先进的画面。

研究人员分析了育空中的四个位点的多年冻土样品，每个样品在大约11,000年前发生的全兴 - 卤代转变中的不同点。

这一转型特征是大量动物物种，如猛犸象，乳房和地面懒惰，而新过程已经产生了一些关于展开事件的令人惊讶的新信息，就是研究人员。例如，他们建议羊毛猛犸象幸存下来远远超过最初相信。

在育空样品中，他们发现了一系列大量动物的遗传残余，包括猛犸象，马，野牛，驯鹿和数千种植物，这些都是从小到0.2克沉积物。

科学家们认为，羊毛猛犸象和马匹仍然存在于育空的克隆克地区，最近9,700年前，比以前的研究仍然提出了以前的研究。

Tyler Murchie是人类学部的博士候选人和该研究的主要作者。

“那些土壤含有巨大的灭绝动物和植物的DNA，从另一个时间和地点含有巨大的植物，使得一位新的侦探工作能够揭开我们的冻结过去，”涉及论文和主任麦克马斯特古代德纳中心。“这项研究使我们能够最大限度地通过时间来最大限度地提高DNA保留和微调我们对变化的理解，包括气候事件和人类移民模式，没有保留。”

该技术解决了科学家的长期问题，他们必须将DNA与沉积物混合的其他物质分开。该过程通常需要苛刻的治疗，实际上摧毁了他们正在寻找的大部分可用的DNA。但是，通过利用新的提取策略组合，麦克马斯特研究人员已经证明了可以比以往任何时候都更容易保留更多的DNA。

“那些动物和植物的所有DNA都是一个小斑点的污垢，”泰勒·默奇尼解释说，人类学系和研究领先作者的博士候选人。

“生物在他们的生活中不断脱落细胞。例如，人类每天都会脱掉半百亿皮肤细胞。大部分遗传物质迅速降解，但通过沉积矿物结合，一些小部分保证为千年，并在那里等待我们恢复和研究。现在，我们可以通过从非常少量的沉积物中恢复环境DNA的巨大普及，并且在完全没有任何存活的生物组织的情况下进行一些显着的研究。“

参考：“优化古环保DNA的提取和靶向捕获，使用Palaeochip Arctic-1.0诱饵套装重建过去的环境”通过Tyler J. Murchie，Melanie Kuch，Ana T. Duggan，Marissa L. Ledger，Kévin罗氏，Jennifer Klunk，Emil Karpinski，Dirk Hackenberger，Tara Sadoway，Ross Macphee，Duane Froese和Hendrik Poinar，2020年9月1日，Qualthearn.Doi：
10.1017 / QUA.2020.59

该工作是与艾伯塔大学的研究人员进行的。