基因组测试精确区分病毒和细菌感染

由Duke University医学院的研究人员开发的新基因组测试可以准确地分类病毒和细菌感染，可能有助于限制抗生素过度使用和细菌抗性的出现。

研究人员开发的血液试验在呼吸疾病的人们测试时，在区分病毒和细菌感染方面的精度超过90％以上。

检测病人的免疫系统作为对病毒的反应的特定遗传“签名”的测试证明了诊断长期难以定位的疾病来源的潜在新方法。

报告于2013年9月18日，发出杂志的科学翻译医学，发现该技术更接近临床用途，在那里它可以帮助患者获得更快的诊断和治疗，同时抑制不必要的抗生素不起作用的抗生素关于病毒感染。

“在大流行流感或中东爆发的电晕病毒等情况下，诊断比使用传统诊断的更加准确和更快的病毒性疾病非常重要，”联合高级教师Geoffrey S. Ginsburg，MD，博士，杜克大学医学院基因组医学与医学教授主任。“目前的测试需要了解病原体以确认感染，因为它们是特定于应变的。但是，当新的未知病原体出现时，我们的测试可以立即使用。“

当受病毒感染时，一个人的免疫系统的反应与打击细菌感染时的反应不同。这些差异在遗传水平上是显而易见的，其中某些基因在病毒攻击期间接通，产生广泛识别抑制病原体的指纹。

在以前的工作中，Duke团队描述了使用特殊检验的血液测试的发展，以鉴定涉及同意感染一系列常见上呼吸病毒的志愿者的病毒感染的一些30个基因。

与目前的测试不同，依赖于血流病原体的证据的证据 - 要求了解该特定虫子来检测它 - 新方法可用于检测未知的新兴疾病，包括潜在的生物恐怖主义威胁。

“这不仅重要的是在病毒性大疱中的感染可能是由未知病毒引起的，而且在常规护理中，患有抗生素的决定是至关重要的，”副手，MHS，MHS副教授公爵的传染病和国际健康。

目前的研究是“真实世界”设置中的验血试验。在102人到达医院的急诊肿瘤发烧中，28例病毒感染，39例细菌感染，35例是健康的对照。使用该测试，公爵研究人员能够准确地将超过90％的患者分类为病毒感染。

该测定为89％的病例中的病毒感染提供了真正的阳性鉴定，并正确排除了94％的时间的负面情况。

研究人员表示，计划更大的研究，并正在进行额外的工作来修剪测试结果所需的时间。吉斯堡表示，该测试目前需要12小时，并分析约30个基因。他说的时间和基因的数量都可以被削减。

“我们非常高兴的是，该测定可以挑选出具有高精度病毒感染的人，”Zaas说。“这也许是这项努力最重要的方面 - 在真实世界的环境中新测试的准确性。这是测试成为帮助医生和患者的有用诊断的重要一步。“

Co-Sear Author Christopher W. Christopher W. Offs，MD，MPH，Duke，Durham VA Medical Center和Duke Global Health Institute担任Duke，Durham VA Medical Center和Duke Global Health Institute，如果已被证明在额外的研究中，可以帮助解决传染病周围的一些最紧迫的问题。

“目前的全球性威胁之一是细菌抗性的出现，这在很大程度上被过度使用抗生素，”伍兹说。“这是一个不断增长的公共卫生威胁，产生越来越难以管理的感染。一种使我们能够准确识别病毒感染的工具可以抑制含有抗生素的滥用使用并降低抗性病原体的发展。“

除了吉斯堡和森林外，研究作者还包括Thomas Burke，Minhua Chen，Micah McClain，Timothy Veldman，以法弗莱斯·沃尔德曼，以法普莱姆L. Tsalik，Vance Fowler，Emanuel P. Rivers，Ronny Otero，Stephen F. Kingsmore，Deepak Voora ，约瑟夫卢卡斯，阿尔弗雷德o.英雄和劳伦斯·克林。

该研究部分受到国防高级研究项目机构，国家过敏和传染病（AI066569）和退伍军人事务部的支持。

GINSBURG，ZAAS，森林，英雄，顾问和卢卡斯在呼吸道病毒签名上提出了临时专利。研究中提供了更全面的披露。

出版物：基于宿主的RT-PCR基因表达签名，以鉴定急性呼吸道病毒感染，“2013年9月18日科学翻译医学：卷。 5，问题203，p。 203RA126; DOI：10.1126 / scitranslmed.3006280

图像：公爵全球卫生研究所