中国热科学研究院发布芒果精细基因组图谱

时间：2021-06-30 12:58:00来源：

中国热科学研究院材料科学技术研究院（ICTS）与中国科学院微生物研究所（CAS）和其他10个机构合作，将精细基因组定位在该基因的染色体水平上。芒果，并在基因组水平上揭示了芒果物种的进化机制和栽培品种的历史。研究结果在线发表在基因组生物学（IF = 14.028）上，这是基因组学领域的国际顶级期刊。

通过深度测序和组装传统芒果品种阿方索，研究团队获得了大小为393Mb的芒果的精细基因组图。对装配和注释结果的分析表明，芒果祖先在3300万年前经历了全基因组复制事件，并且复制的双拷贝基因被选择性地保存在与能量代谢有关的基因中，这可能提供了适应性优势。应对芒果在此期间大气CO2浓度的急剧下降和全球降温。同时，研究小组确定了许多扩展的基因家族之一，称为CHS，可能与漆酚的合成有关。Lacquerol是Lacaceae家族中的物种（例如芒果）所特有的物质，会在人类中引起强烈的过敏反应。该发现将为阐明漆酚合成的分子机理提供基础。该项目还对芒果的48个芒果物种和4个紧密相关的物种进行了重新排序。进一步的分析表明，传统的芒果品种被分为印度和东南亚两个主要的分类单元，而大多数商业品种表现出等位基因混合。出现在中国南部和东南亚国家的芒果农用植物在东南亚的生物分类中形成了独特的分支。有趣的是，海南和该地区其他地区的农用植物资源也显示出与商业品种相似的等位基因混合。