开发的新工具序列圆形DNA

时间：2022-02-03 12:58:03来源：

如图所示，是苹果酒SEQ，一种用于测序圆形和面包瘤圆形DNA的新开发的工具，行动。

新方法将向细菌和病毒的基因组提供洞察力，以及哺乳动物和植物中的面料血型圆形DNA。

根据一项新研究，艾伯塔大学生物学家已经发明了一种测序圆形DNA的新方法。典型的垃圾箱 - SEQ-将提供其他科学家的富含科学家，在任何类型的细胞中都有圆形DNA的准确数据。

虽然我们自己的DNA是线性的，但圆形DNA在细菌和病毒的基因组中是常见的。科学家们还发现了人和植物细胞核内的圆形DNA，称为面料瘤圆形DNA（ECCDNA）。最近，研究已经开始调查Eccdna在人类癌症中的作用 - 但由于缺乏用于学习和测序ECCDNA的有效方法而导致的进展受到阻碍。

“我们的关键进步是，通过我们的方法，科学家终于可以获得任何类型的细胞中对循环DNA的无偏见，高分辨率的认识，”解除生物科学和铅作者博士后的博士法文解释道。“通过我们的发明发明，我们可以开始开始在人和植物细胞中开始了解这些神秘的圆形DNA的功能。”

含有名为PACBIO的DNA测序技术使用DINER-SEQ。该方法包括Web实验协议，以及新的计算流水线。它经过优化，以检查病毒基因组和eCCDNA，并可在线提供其他科学家访问。

“我们设计了一种新的分子生物学方法和一种新的生物信息学算法，最终获得了ECCDNA的全长序列，”Mehta解释说。“我们的方法最终允许我们完全序列这些分子，并给我们和其他研究人员能够更好地理解他们在细胞中实际做的工具。”

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参考：Devang Mehta，Luc Cornet，Matthias Hirsch-Hoffmann，Syed Shan-E-Ali Zaidi和HervéVanderschuren，4月2020年4月，自然协议。
10.1038 / s41596-020-0301-0.

这项工作是与比利时列日大学的Herve Vanderschuren合作。

Mehta从瑞士国家科学基金会和欧盟委员会第七框架计划提供了该研究的资金。Vanderschuren实验室由Fonds de la Recherche Scientifique和欧洲联盟的Leavagri计划提供支持。