时间:2021-10-07 10:58:01来源:
几个新出版的研究表明,苍蝇,蠕虫和人类分享了基因表达的古老模式。
虽然在数十亿年的进化,苍蝇,蠕虫和人类分享了基因表达的古老模式,但根据基因组数据的大规模耶鲁LED分析。
由科学家们在哈佛大福和斯坦福的两个相关研究,也发表于8月28日在同一问题上,讲述了类似的故事:即使人类,蠕虫和苍蝇彼此相似,也使用了类似的分子工具包来塑造它们。
但是,同样的耶鲁实验室报告在国家科学院诉讼程序中发表的单独论文中,其在伪原地填充的基因组区域的物种之间的巨大差异,运作基因的分子化石。
人,蠕虫和飞行基因组均由相同的构建块(即核苷酸)组成,但大小差异。例如,人类基因组比蠕虫和飞行大超过10倍。然而,三种具有蛋白质代码的相当数量的功能基因。更突醒,注意研究人员,这三个分享了许多表达程序以协调的方式转向和关闭基因。事实上,基因表达模式如此相似,即调查人员能够使用它们来匹配蠕虫和飞行开发的阶段。
“在大约十亿年代的伊尔··威廉姆斯(Albert L. Williams)的生物医学信息学教授,在其中一篇自然论文之一的高级作者的生物医学信息学教授。“它还说明了模型生物如何帮助我们注释人类基因组的研究。”
该研究 - 由Gerstein实验室的成员陪伴,包括Joel Rozowsky,Koon-Kiu Yan,Daifeng Wang,Baikang Pei和Arif Hymanci - 看着转录模式,DNA中编码的过程转移到RNA。本文还报道,通过包装DNA的控制在所有生物体中的控制非常相似。事实上,作者能够为人类的转录来构建定量模型,然后成功地应用它而不改变飞行和蠕虫。
来自数十家机构的200多名科学家贡献了这项努力,这是编码基因组学联盟的一部分。所产生的论文在大自然中出版所有讲述物种之间共同演化的类似故事 - 例如,基因调节网络的共同性和控制其激活的转录因子。
“当我们看看苍蝇或蠕虫时,很难相信人类与他们有任何共同之处,”格斯坦说。“但现在我们可以看到他们的深度相似之处,更好地帮助我们解释人类基因组。”
然而,当Gerstein的实验室看着伪原的实验室时出现了Stark差异 - 延伸的DNA已经失去了原始蛋白质编码基因功能,并且不再在强烈的选择性约束下,有效地代表分子化石。在8月25日,耶鲁科学家在这些化石方面报告了有机体之间存在巨大差异,反映了苍蝇,蠕虫和人类的佩特进化历史。
“一方面,我们看到了反映生物学必需品的相似之处,另一方面,反映了有机体历史的差异,”Gerstin的实验室博士后研究员和伪科学第一次作者的第一个作者克里斯蒂娜·斯萨斯说。
该工作由全国人类基因组研究所提供资金。
刊物:
Alan P.Boyle等,“远处物种的监管信息和电路的比较分析”2014年8月28日“(2014年8月28日); DOI:10.1038 / Nature13668Joshua W.K.Ho,等人,“美唑烷染色质组织的比较分析”,“自然512,449-452(2014年8月28日); DOI:10.1038 / Nature13415cristina Sisu,等,“三个脑袋中的伪原的比较分析”,2014年PNAS; DOI:10.1073 / PNA.1407293111图像:Darryl Leja,Nhgri,NIH
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